En Indre-et-Loire, les barrages sur le Cher doivent être ouverts de novembre à juin pour laisser passer les poissons migrateurs, ce qui n'est pas sans conséquence pour la rivière et son développement touristique. Selon Jacky Marquet, le vice-président du syndicat du Cher canalisé qui regroupe les 15 communes bordant le Cher, « quand ces barrages sont ouverts, le niveau du Cher est réduit de moitié, empêchant tout un tas d’activités comme la navigation. Le Cher, pendant 4 mois, a alors une physionomie différente du reste de l’année, ça a forcément une conséquence sur la faune et la flore ». Jacky Marquet prône donc l’installation de passes à poissons sur tous les barrages (il en faudrait une petite dizaine, coût estimé : 28 millions d'euros !) pour permettre une cohabitation harmonieuse entre tous les usagers, il vient de faire signer une pétition en ce sens aux présidents d’associations de pêche d’Indreet- Loire.

Parallèlement, une étude est lancée sur la faisabilité d'un transfert de la propriété du Cher canalisé de l'État vers l’Établissement Public Loire, qui regroupe 6 régions et dont le président est le maire de Tours, Jean Germain. Stéphane Merceron, son directeur de cabinet, indique à ce propos que « cette réflexion aura un caractère opérationnel au début du mois d'avril. Il existe un consensus sur la nécessité d'investissements pour concilier les usages de la rivière. C'est un programme qui coûtera autour de 10 millions d'euros ». Mais, la question de la propriété du Cher doit d'abord être réglée. « Par ailleurs, il serait inopportun de commencer ce programme alors que l'obstacle des barrages de Rochepinard à Tours n'est pas encore levé », ajoute Stéphane Merceron. La solution est déjà trouvée : c'est la rivière de contournement sur l'île Balzac. Alain Goudeau, adjoint au maire chargé des grands projets urbains, précise : « pour la première fois, on a mis autour de la table pêcheurs, navigants et associations écologistes ». Une véritable révolution puisqu’il y a encore quelques années, les véliplanchistes sur le lac de la Bergeonnerie recevaient du petit plomb de la part de certains pêcheurs. « Ces rencontres ont permis de mettre sur pied le projet de la rivière de contournement sur l’île Balzac pour éviter les 2 barrages infranchissables, ça va permettre aux poissons de circuler, et comme l’école de canoë-kayak est importante à Tours, cette rivière artificielle va aussi devenir un nouvel équipement sportif et d’apprentissage de la nature, avec la possibilité d’adapter son débit ».